Новое руководство по автоматизации поиска литературы в PubMed с помощью LangChain
23 июля 2025 года вышел подробный материал, в котором команда MarkTechPost представила Advanced PubMed Research Assistant — инструмент на базе LangChain, способный полностью автоматизировать поиск и анализ публикаций в базе PubMed без лишней суеты.
Сначала мы устанавливаем ключевые пакеты: langchain‑community для работы с PubMed, xmltodict для разбора XML ответов, pandas для структурирования данных и matplotlib вместе с wordcloud для наглядной визуализации.
Далее создаётся класс-исследователь: внутри него инициализируется инструмент PubmedQueryRun, а также настраивается LangChain‑агент, который умеет принимать запросы вроде «CRISPR gene editing» и возвращать дату публикации, заголовок и краткий анонс статьи.
Результаты запросов сохраняются в кэше и могут мгновенно переиспользоваться. Это особенно удобно при повторных экспериментах или когда нужно собрать большой пул работ для тренд-анализа.
В завершение автор показывает, как на основе полученных данных строить графики: изменение количества публикаций по годам, облако ключевых слов, распределение по тематикам — всё это наглядно и без лишних усилий.
Этот пайплайн не только экономит часы ручной работы, но и открывает новые возможности для быстрой проверки гипотез и глубокого понимания эволюции научных трендов.
