Новая AI-система CellLENS объединяет данные о расположении, молекулярном составе и морфологии клеток, что позволяет выявлять ранее неразличимые субпопуляции иммунных клеток в тканях.
Инструмент CellLENS, разработанный исследователями из MIT и ряда ведущих университетов США, сочетает в себе свёрточные и графовые нейронные сети для создания комплексного цифрового профиля каждой клетки. Это позволяет группировать клетки по сходству их биологии, выявляя даже те популяции, которые при традиционном анализе остаются незамеченными.
В недавней публикации в журнале Nature Immunology описано применение CellLENS к образцам здоровой ткани, лимфомы и рака печени. Система обнаружила редкие T-лимфоциты, концентрирующиеся на границе опухоли или присутствующие в отдалённых зонах, что важно для разработки более эффективных иммунотерапевтических стратегий.
«Теперь мы не просто определяем клетку как T-клетку, но можем уточнить её субпопуляцию, функциональное состояние и потенциальную роль в опухолевом процессе», — поясняет руководитель работы Бокай Чжу, постдок из MIT и Broad Institute.
Перспективы и прогнозы
По словам соавтора исследования профессора Алекса Шалека из MIT, CellLENS способна ускорить выдвижение новых биомаркеров и таргетных терапевтических препаратов. При правильном подборе входных данных и последующей валидации такие инструменты будут способствовать более быстрой трансляции научных данных в клинические решения.
